CABARAN paling besar yang dihadapi Jawatankuasa Fatwa kini adalah menangani perkembangan pesat bidang sains bioperubatan dan teknologi baru seperti kajian sel induk dan teknik penghasilan zuriat.
Pertumbuhan dalam sektor sains malah dilihat jauh lebih pesat daripada kesediaan kepimpinan agama itu sendiri dalam membuat keputusan (berhubung dengan fatwa) bagi setiap perkembangan baru yang dikesan.