MASJID En-Naeem sedia menerapkan nilai-nilai murni kepada pelajar kanak-kanak dan belianya supaya pembangunan duniawi dan ukhrawi saling melengkapi.
Ini dilakukan melalui program pendidikan prasekolah hingga tadika buat kanak-kanak berusia antara tiga dan enam tahun dan program madrasah aLIVE.